專家意見征詢問卷

尊敬的專家：

您好！

為進(jìn)一步完善化學(xué)物毒作用機制研究中的多源數(shù)據(jù)庫整合、證據(jù)評價及機制可信度分析方法，特邀請請各位專家圍繞數(shù)據(jù)庫、毒性終點選擇、證據(jù)整合及機制評價等內(nèi)容進(jìn)行選擇，感謝您在百忙之中給予指導(dǎo)與支持！

一、數(shù)據(jù)庫選擇

在化學(xué)物毒性數(shù)據(jù)獲取過程中，您認(rèn)為適合納入的數(shù)據(jù)庫包括哪些?（可多選）

ToxcastCTD其他:__________

Q2 在全面收集化學(xué)物相關(guān)靶點信息整合過程中，您認(rèn)為適合的數(shù)據(jù)庫或平臺包括哪些?（可多選）

ChEMBLCTDSTITCHSwissTargetPrediction其他:

Q3 在構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)（PPI）時，您認(rèn)為適合納入的數(shù)據(jù)庫包括哪些?

STRING其他:

Q4在機制通路的功能評價與注釋過程中，您認(rèn)為適合參考的數(shù)據(jù)庫包括哪些?（可多選）

KEGGGOReactome其他:

二、毒性終點與疾病信息

Q5、在化學(xué)物毒作用機制研究中，考慮生物學(xué)覆蓋度的飽和效應(yīng)、統(tǒng)計功效與信噪比因素前提下，您認(rèn)為以下哪些毒性終點適合作為非特異性毒性終點評價指標(biāo)?（可多選）

細(xì)胞活力、細(xì)胞增殖，氧化應(yīng)激、線粒體功能、細(xì)胞死亡、炎癥反應(yīng)其他:

三、ToxCast毒性數(shù)據(jù)評價

Q6、在ToxCast毒性數(shù)據(jù)評價中，您認(rèn)為采用“效應(yīng)強度”與“數(shù)據(jù)可靠性”兩個維度進(jìn)行綜合評價，并適當(dāng)提高效應(yīng)強度相關(guān)指標(biāo)的重要性，以突出毒性效應(yīng)本身，是否合理?

合理一般不合理，建議:

Q7、在ToxCast毒性效應(yīng)評價中，您認(rèn)為采用半數(shù)最大活性濃度（AC50）與曲線擬合最大值（TOP）聯(lián)合反映化學(xué)物毒性潛力，并以AC50作為主要評價指標(biāo)，是否合理?

合理一般不合理，建議:

Q8、在ToxCast數(shù)據(jù)可靠性評價中，您認(rèn)為考慮細(xì)胞毒性干擾（CYTOTOX_BURST）與曲線擬合質(zhì)量（ACC）兩個維度，是否合理?

合理一般不合理，建議:

Q9、在化學(xué)物活性效價評價中，您認(rèn)為采用區(qū)間分層方式來劃分梯度區(qū)間，并進(jìn)行評價，是否合理?

合理一般不合理，建議:

四、CTD表型與疾病證據(jù)評價

Q10、在CTD中化學(xué)物—表型關(guān)系評價中，您認(rèn)為綜合考慮作用關(guān)系、證據(jù)支持強度、物種相關(guān)性信息，以更全面反映表型證據(jù)可信度，是否合理?

合理一般不合理，建議:

Q11、在CTD化學(xué)物—疾病關(guān)系評價中，您認(rèn)為綜合考慮證據(jù)關(guān)系類型與證據(jù)支持強度，并適當(dāng)提高證據(jù)關(guān)系類型的權(quán)重，且對同時具有表型與疾病層面支持的證據(jù)適當(dāng)提高可信度，是否合理?

合理一般不合理，建議:

五、化學(xué)物—靶點關(guān)系評價

Q12、在化學(xué)物—靶點關(guān)系評價中，您認(rèn)為采用實驗數(shù)據(jù)、文獻(xiàn)支持?jǐn)?shù)據(jù)與預(yù)測數(shù)據(jù)等多來源信息進(jìn)行綜合分析，并重點參考實驗驗證及多來源共同支持信息，是否合理?

合理一般不合理，建議:

六、機制通路與綜合評價

Q13、在機制通路評價中，您認(rèn)為從“功能相關(guān)性”、“證據(jù)強度”、“證據(jù)質(zhì)量”三個層面進(jìn)行綜合評價，并且給予功能相關(guān)性更高的權(quán)重以體現(xiàn)機制功能導(dǎo)向，是否合理?

合理一般不合理，建議:

Q14、在機制通路的功能相關(guān)性評價中，您認(rèn)為結(jié)合KEGG與GO等數(shù)據(jù)庫中的通路功能與術(shù)語注釋信息進(jìn)行綜合評價，是否合理?

合理一般不合理，建議:

Q15、在機制通路證據(jù)強度評價中，您認(rèn)為綜合考慮靶點富集情況及基因在通路中的作用信息，是否合理?

合理一般不合理，建議:

Q16、在機制通路證據(jù)質(zhì)量評價中，您認(rèn)為同時考慮數(shù)據(jù)庫注釋證據(jù)等級與多數(shù)據(jù)庫一致性支持情況，以提高機制可信度評價的穩(wěn)定性，是否合理?

合理一般不合理，建議:

Q17、當(dāng)部分?jǐn)?shù)據(jù)庫信息缺失時，您認(rèn)為利用動態(tài)調(diào)整評價權(quán)重的方式，根據(jù)可獲取信息進(jìn)行綜合評價是否合理?

合理一般不合理，建議:

七、整體毒作用機制可信度評價

Q18、在毒作用機制整體可信度評價中，您認(rèn)為需要綜合以下哪些層面的證據(jù)關(guān)系?

機制鏈核心的功能與通路信息化學(xué)物—靶點關(guān)系毒性終點/表型/疾病的關(guān)聯(lián)證據(jù)PPI網(wǎng)絡(luò)內(nèi)部調(diào)控信息其他:

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